Логическая структура Active Directory реализуется в виде набора объектов различных классов, хранящихся в каталоге. В этом отношении Active Directory значительно отличается от других каталогов, имеющих логическую структуру, но хранящих ее в виде текстового файла, к которому система обращается при запуске. Хранение логической структуры в каталоге имеет целый ряд преимуществ. Например, приложения пользователей могут обращаться к логической структуре и с ее помощью определять наличие тех или иных объектов и свойств.

Логическая структура Active Directory может обновляться динамически. Это означает, что приложение может расширить логическую структуру, добавив в нее новые атрибуты и классы, и сразу после этого воспользоваться полученным расширением. Обновление логической структуры производится путем создания новых или модификации существующих объектов логической структуры (schema objects), хранящихся в каталоге. Как и все остальные объекты в Active Directory, объекты логической структуры защищены списками контроля доступа (access control lists, ACLs), поэтому изменять логическую структуру могут лишь пользователи, имеющие определенные права (авторизованные пользователи).